تتمتع المشروعات الواقعة في المنطقة الاقتصادية لقناة السويس، التي تهدف إلى جذب الاستثمارات العالمية وإنشاء مشروعات زراعية وصناعية وخدمية على مستوى عالٍ من التنافسية والجودة، وزيادة حجم التجارة الخارجية لمصر، بحوافز ضريبية وجمركية مغرية، وهي:
1- إعفاء الهيئة المسؤولة عن إقامة المنطقة والشركة التنموية الرئيسية والشركات والمنشآت والفروع المرخص لها بالعمل في المنطقة من جميع أنواع الضرائب والرسوم على عوائد السندات والقروض والتسهيلات الائتمانية.
2- إعفاء الأرباح التي تتحقق من عمليات اندماج أو تقسيم أو تغيير شكل قانوني للشركات من الضرائب والرسوم المستحقة بسبب هذه العمليات.
3- عدم تطبيق قوانين ضرائب المبيعات والدمغة ورسم تنمية موارد الدولة على المنطقة، بالإضافة إلى عدم فرض أي نوع آخر من الضرائب أو الرسوم سواء كانت مباشرة أو غير مباشرة.
4- إعفاء كل ما تستورده الهيئة أو الشركات أو المنشآت أو الفروع من خارج البلاد من المعدات والآلات والأجهزة والمواد الخام والمهمات وقطع الغيار وغيرها من المواد أو المكونات التي تحتاجها للقيام بالنشاط المرخص به داخل المنطقة من جميع أنواع الضرائب الجمركية وضريبة المبيعات وغيرها من الضرائب والرسوم.
5- إعفاء جميع أنواع السيارات والمركبات من جميع أنواع الضرائب والرسوم إذا كانت مخصصة لإنتاج سلع أو خدمات داخل المنطقة، بحسب المعايير التي يحددها مجلس إدارة الهيئة.
